fromage
stable

General

  • 1. Program overview and install
  • 2. Essential glossary
  • 3. Tutorial for geometry optimisation
  • 4. License
  • 5. Contact
  • 6. References

Theoretical background

  • 1. ONIOM cluster models
  • 2. Ewald point charge fitting
  • 3. Minimal Energy Conical Intersection optimisation
  • 4. Population analysis

Program documentation

  • 1. Interfaces
  • 2. Input file description
  • 3. Structure manipulation in fromage
  • 4. Miscellaneous scripts
  • 5. fromage
    • 5.1. fromage package
fromage
  • Docs »
  • 5. fromage
  • Edit on GitHub

5. fromageΒΆ

  • 5.1. fromage package
    • 5.1.1. Subpackages
      • 5.1.1.1. fromage.fdist package
        • 5.1.1.1.1. Submodules
        • 5.1.1.1.2. fromage.fdist.fdist module
        • 5.1.1.1.3. Module contents
      • 5.1.1.2. fromage.io package
        • 5.1.1.2.1. Submodules
        • 5.1.1.2.2. fromage.io.edit_file module
        • 5.1.1.2.3. fromage.io.parse_config_file module
        • 5.1.1.2.4. fromage.io.read_file module
        • 5.1.1.2.5. Module contents
      • 5.1.1.3. fromage.scripts package
        • 5.1.1.3.1. Submodules
        • 5.1.1.3.2. fromage.scripts.fro_assign_charges module
        • 5.1.1.3.3. fromage.scripts.fro_coupling module
        • 5.1.1.3.4. fromage.scripts.fro_dimer_tools module
        • 5.1.1.3.5. fromage.scripts.fro_pick_mol module
        • 5.1.1.3.6. fromage.scripts.fro_pop_stat module
        • 5.1.1.3.7. fromage.scripts.fro_prep_run module
        • 5.1.1.3.8. fromage.scripts.fro_run module
        • 5.1.1.3.9. fromage.scripts.fro_uc_tools module
        • 5.1.1.3.10. fromage.scripts.fro_volumetrics module
        • 5.1.1.3.11. Module contents
      • 5.1.1.4. fromage.utils package
        • 5.1.1.4.1. Subpackages
        • 5.1.1.4.2. Submodules
        • 5.1.1.4.3. fromage.utils.atom module
        • 5.1.1.4.4. fromage.utils.calc module
        • 5.1.1.4.5. fromage.utils.dimer module
        • 5.1.1.4.6. fromage.utils.fit module
        • 5.1.1.4.7. fromage.utils.per_table module
        • 5.1.1.4.8. fromage.utils.run_sequence module
        • 5.1.1.4.9. fromage.utils.volume module
        • 5.1.1.4.10. Module contents
    • 5.1.2. Module contents
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